El Profesor Aguilar es ingeniero civil por la Universidad Michoacana, Tiene una maestría y un doctorado de la Escuela de Economía y Ciencias Políticas de Londres. Pertenece al Sistema Nacional de Investigadores, con nivel III. Ha trabajado para el sector público a nivel federal, y realizado investigación y consultoría nacional e internacional en temas de urbanización, agua urbana y la región fronteriza México-Estados Unidos, para instituciones como Comisión Nacional del Agua, Banco Mundial, Organización Meteorológica Mundial, Banco de Desarrollo de América del Norte, y Naciones Unidas-Habitat.
El Profesor Aguilar es el editor principal del libro Agua y Ciudades en América Latina, publicado en inglés, en 2015, por la editorial británica Routledge, y en español, en 2018, por el Banco Inter Americano de Desarrollo. Este trabajo mereció el Premio a la Investigación Tecnológico de Monterrey/Rómulo Garza 2019. Es también co-autor del libro Agua para Monterrey (noviembre 2021), en el cual se muestran los retos y las oportunidades de la disponibilidad del agua para Nuevo León y México. El Profesor Aguilar representa al Tecnológico de Monterrey en el Consejo Consultivo del Agua.